Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20918J3QN17 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20918J3QN17 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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