Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm11236J3QMS7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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