Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms