Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20815J3KMI0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms