Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm28048F7BCN0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms