Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc8E9PWG2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms