Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms