Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clip3B9EHT4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clip3B9EHT4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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