Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usf3B2RUQ2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms