Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms