Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zscan5bB2RTN3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms