Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rrn3B2RS91 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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