Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms