Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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