Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms