Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms