Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prg4Q9JM99 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Prg4Q9JM99 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Prg4Q9JM99 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Prg4Q9JM99 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Prg4Q9JM99 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prg4Q9JM99 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms