Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tgm1Q9JLF6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms