Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms