Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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