Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smco4Q9JIS3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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