Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms