Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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Pop5Q9DB28 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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