Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D9S1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D9S1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D9S1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms