Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms