Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms