Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms