Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MsraQ9D6Y7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms