Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syf2Q9D198 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms