Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hddc3Q9D114 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms