Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Malsu1Q9CWV0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms