Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d3Q9CSV6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d3Q9CSV6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms