Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ergic3Q9CQE7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms