Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NsmfQ99NF2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NsmfQ99NF2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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