Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl3Q99N95 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms