Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Brms1Q99N20 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Brms1Q99N20 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Brms1Q99N20 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Brms1Q99N20 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Brms1Q99N20 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Brms1Q99N20 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brms1Q99N20 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms