Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Ms4a4dQ99N05 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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