Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprtQ99M80 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms