Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5lQ99LH9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sh3bp5lQ99LH9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms