Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1bQ99JY6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms