Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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