Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan1Q99J59 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms