Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctu1Q99J10 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctu1Q99J10 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctu1Q99J10 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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