Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms