Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klc3Q91W40 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms