Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf4Q8VE97 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf4Q8VE97 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms