Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh10Q8VCH7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh10Q8VCH7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh10Q8VCH7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh10Q8VCH7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh10Q8VCH7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh10Q8VCH7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh10Q8VCH7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Rdh10Q8VCH7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rdh10Q8VCH7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rdh10Q8VCH7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh10Q8VCH7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rdh10Q8VCH7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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