Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top1mtQ8R4U6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms