Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms