Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MyripQ8K3I4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms